Szymon Jakubowski studierte Klavier an der Hochschule für Musik Hanns Eisler Berlin bei Prof. Annerose Schmidt und Prof. Galina Iwanzowa sowie anschließend Orgel und Orgelimprovisation an der Universität der Künste Berlin bei Prof. Leo van Doeselaar, Prof. Wolfgang Seifen, Erwin Wiersinga und Prof. Paolo Crivellaro. Im Jahr 2014 schloss er das Konzertexamen in Orgelimprovisation mit Auszeichnung ab. Er ist Preisträger mehrerer Improvisationswettbewerbe, darunter der Richard-Wagner-Improvisationswettbewerb und der Arthur-Pichler-Orgelimprovisationswettbewerb.

Neben seiner Konzerttätigkeit verfügt Szymon Jakubowski über langjährige pädagogische Erfahrung. Derzeit unterrichtet er schulpraktisches Musizieren an der Hochschule für Musik und Theater Leipzig sowie Orgelimprovisation an der Universität der Künste Berlin.